不同類型的高效過濾器在過濾材料、應用場合和工藝要求上有的差異，這也決定了它們的過濾效率。其中，影響高效過濾器效率的重要因素之一是過濾材料的空氣阻力。眾所周知，高效過濾器安裝在潔凈室的通風和空調系統中。當空調系統中流動的氣流接觸到高效過濾器的過濾材料時，會產生輕微的阻力，讓氣流繞過。隨著高效過濾器使用時間的增加以及灰塵和雜質的堆積，高效過濾器的表面阻力會越來越大。

高效過濾器能夠適應的空調系統風速也是決定高效過濾器效率的重要參數之一。一般來說，空調系統的風速越低，小塵埃的擴散作用就更明顯，空調氣流在高效過濾器之中留存的時間越長，高效過濾器過濾的效率也就越高。使用相同的高效過濾器，每次風速加倍時，空調系統的效率都會降低一個數量級。

高效過濾器的阻力會隨著氣流量和流速的增大而增加，被捕捉或粘附的粉塵也會導致其氣阻進一步增大。因此，高效過濾器的過濾面積將影響過濾材料的空氣阻力，從而間接影響高效過濾器的效率。